“Googleで大規模障害発生。”で書いた件ですが、原因は人的なものだったとのこと。
“/”という文字を誤ってフィルタリングしてしまったのが原因だと。
このリストは StopBadware.org という非営利団体と共同で管理しているようです。

Googleの声明
“Official Google Blog: This site may harm your computer” on every search result?!?!“
“Google Japan Blog: 全ての検索結果に「このサイトはコンピュータに損害を与える可能性があります。」というメッセージが表示された件について“

また同時にGmail 迷惑メールフィルタでも問題が出ており、一部のメールを迷惑メール扱いしていたとのこと。
一度確認しておいたほうがいいんじゃないでしょうか。
“Google Japan Blog: Gmail 迷惑メールフィルタの問題について“